《熱血三國》中共有二十種科技，隨著科技等級越高，效果和威力都會提升。比如：“練兵技巧”可以縮短士兵訓練時間；“拋射技巧”可以增加遠程攻擊距離。同時，這些科技也是發展出高級建筑和兵種的前提保證。在熱血三國中，建筑物的升級和兵種的升級都與科技樹交叉在一起，因此玩家需要兼顧多項平衡發展。如果玩家不努力提升技巧的話，到后期將寸步難行。

玩家可以在城池中建設書院，然后在書院中發展科技。書院的等級越高，能夠研究的科技越多。一所書院同一時間只能研究一項科技，建設多所書院可以同時研究不同的科技。有許多科技的研發需要先滿足一些特定的建筑等級要求。
 

與其他內政項目相比，發展科技需要花費更多的資源、更長的升級時間，但一旦發展成功，玩家的城池都可以共享科技成果，獲得極大的發展推動，可以說是利國利民的長遠之計。（注意：書院必須達到指定等級，才能共享已經擁有的科技。比如10級的“偵察技巧”需要書院等級3，即使主城把“偵察技巧”已經提升到10級，但是分城的書院必須達到3級，才能共享10級“偵察技巧”的加成）

需要特別說明的是，如果玩家的最后一個城池被攻占，玩家將會重新創建新城開始游戲，但所有的科技將被保留。這意味著玩家只要建設書院并升級書院就可以重新獲得科技加成。